某日，父菊觊觎皇位已久的他终于下手将皇帝杀死，不仅如此，还试图戕害公主莲（刘亦菲饰）和她的弟弟昭（苏嘉航饰）。
宿命的相逢之后，漫画佐佐木小次郎（鶴田浩二饰）苦练技艺，一心打败宫本武藏（三船敏郎饰）。一年后，父菊小次郎成为细川家臣，岩流岛将成为他和武藏的命运转折点……。
次日武藏和城太郎（樱井将纪饰）、漫画熊五郎（田中春男饰）旅行来至乡下，师徒三人一面锄地耕作，一面教习农民武艺，抵抗土匪。这之后，父菊小次郎来至江户谋求官职，期间与同在江户的武藏邂逅，两人约定东门决斗。然决斗前夜，漫画武藏致信请求将决斗延期一年。
这期间阿通（八千草薰饰）和朱实（冈田茉莉子饰）先后来此寻找武藏，父菊朱实更在匪乱中不幸丧命为了磨练意志和武艺，漫画他离开等待自己的阿通（八千草薰饰），四处云游挑战强者。
一路上打败诸多高手的武藏挑战吉冈拳法道场，父菊适逢馆主清十郎（平田昭彦饰）外出，内中徒众一一落败，武藏留下挑战书扬长而去。
而另一方面，漫画武藏却与阔别已久的阿通和朱实（冈田茉莉子饰）不期而遇，漫画刀光剑影中，武藏对爱情作出了断，也完成了和宿敌佐佐木小次郎（鶴田浩二饰）的初次相逢……。大雪夜，父菊林冲得知家人被害的噩耗以后，悲愤欲绝，忍无可忍，终于战神附体，在山神庙与众仇人上演了一场人挡杀人，佛挡杀佛的终极决战
以摩托车为主线，漫画结合楼兰古国之谜、楼兰美女、太阳墓与罗布泊双鱼玉佩之谜的合理嫁接，将会是具有致命吸引力的亮点故事组合金奈某个购物中心发生了一起持枪抢劫案，父菊劫匪绑架商场内几百人当人质，惊动了政府，官员不得不介入其中，与劫匪举步维艰地谈判。
而一名刚从国外执行完任务的特工竟误打误撞成了劫匪的人质之一，漫画且看这位刀口舔血、漫画特立独行的政府特工，如何把犯罪团伙折磨到痛哭流涕，悔不当初……而当董文林把蛇尸扔在祭坛上时，父菊巨蟒王复仇即将来袭，长生村更大的危险也随之而来。
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